Reisende in Richtung Salzburg erhalten in Traunstein Anschluss an die Ersatzbusse nach Freilassing, ab Freilassing sollen die Reisenden auf die S-Bahn ausweichen. In der Gegenrichtung fahren die S-Bahnen von Salzburg bis Freilassing, in Freilassing besteht Anschluss an die Busse nach Traunstein. Die Reisenden sollen die spätere Ankunft der Ersatzbusse bzw. frühere Abfahrt der S-Bahnen in Salzburg um etwa eine halbe Stunde beachten. Im Zwei-Stunden-Takt fahren durchgehende Regionalzüge zwischen München und Salzburg und in die Gegenrichtung. Die Fahrzeit verlängert sich um etwa zehn Minuten.